教研室共主持和承担科研项目30余项项，其中包括国家自然科学基金项目13项，省部级课题20余项。教研室研究成果发表在《Nature Communication》（ESI高被引）、《Trends in Biochemical Sciences》(封面文章）、《Hepatology》、《Nucleic Acids Research》等，单篇最高他引270余次，累积引用3000余次。特别被CA: a Cancer Journal for Clinicians、Nature Reviews Genetics等杂志论文高度评价。开发的平台已累计被70余个国家6万余次访问，多个平台被omicX收录为ncRNA-ceRNA研究的重要工具。研究成果获省政府科学技术二等奖、省高校自然科学技术成果一等奖等12项。
国家自然科学基金面上项目：癌症免疫关键lncRNA-甲基化修饰调控模块优化及功能研究（32170676），2022年-2025年，在研；
国家自然科学基金面上项目：恶性肿瘤关键突变介导的circRNA-lncRNA-miRNA多层次调控网络扰动模型构建及分析研究(31871338)，2019年-2022年，在研；
国家自然科学基金面上项目：肿瘤免疫微环境中非编码RNA协同调控网络构建及调控机制研究（62073106），2021年-2024年，在研；
国家自然科学基金面上项目：融合增强子活性的肿瘤干性评价算法开发及肿瘤异质性析，2023年-2026年，在研；
国家自然科学基金面上项目：心血管发育与疾病中非编码RNA的表观遗传调控机制及其功能研究（31571331），2016年-2019年，结题；
国家自然科学基金面上项目：融合高通量信息的癌症表观遗传异常的特征提取技术，2011年-2013年，结题；
国家自然科学基金面上项目：基于高通量表观基因组图谱的癌症分子分型的系统分析，2014年-2017年，结题；
国家自然科学基金面上项目：乳腺癌瘤内微环境表观遗传异质性的系统分析及新型分子特征挖掘，2016年-2019年，结题；
国家自然科学基金青年项目：基于生物数据融合的恶性肿瘤中miRNA- ceRNA复合协同调控模式的研究(61203264)，2013年-2015年，结题；
国家自然科学基金青年项目：开发整合基因组和表观基因组特征的增强子RNA精确预测方法及功能分析，2019年-2021年，结题；
国家自然科学基金青年项目：基于多组学数据融合的泛癌中非编码RNA crosstalk模式研究(31601065)，2017年-2019年，结题；
国家自然科学基金青年科学基金项目：基于高通量组学数据的干细胞多能性相关DNA甲基化调控元件识别及其功能分析,2015年-2017年，结题；
国家自然科学基金青年科学基金项目：定量分析癌症基因组DNA甲基化模式复杂性及微进化特征, 2015年-2017年，结题。
省部级课题
黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才：心血管疾病关键ncRNA的优化及其调控机制，2017年-2020年，在研；
黑龙江省国家自然科学基金联合引导项目：肿瘤免疫微环境中ncRNA共调控识别及其机制研究(LH2020C055)，2020年-2023年，在研；
黑龙江省自然科学基金重点项目：乳腺癌分子分析的表观遗传标记识别方法（ZD201503），2014年-2017年，结题；
黑龙江省教育厅科学技术研究项目：整合高通量DNA甲基化数据识别疾病相关的生物标记（12521270），2012年-2014年，结题；
黑龙江省卫生厅项目：整合遗传学和表观遗传学变异识别相似疾病表型的生物学标记，2013年-2014年，结题；
中国博士后第七批特别资助：融合生物数据识别复杂疾病lncRNA及其功能研究（2014T70364），2012年-2015年，结题；
中国博士后第52批面上项目：基于miRNA-miRNA协同调控模式识别恶性肿瘤的分子标记（2013M571436），2012年-2015年，结题；
中国博士后第61批面上项目：癌症中ncRNA交互作用系统识别及其功能特征研究（2017M611385），2017年-2019年，结题；
黑龙江省博士后启动基金：融合多组学数据解析心血管疾病lncRNA的多层次调控机制（LBH-Q17110），2018年-2019年，在研；
黑龙江省博士后启动金：泛癌非编码RNA免疫协同调控网络构建及其临床应用研究（LBH-Q20153），2021年-2023年，在研；
黑龙江省博士后基金项目：非编码RNA（miRNA/lncRNA）协同调控网络重构揭示癌症发生的共性及异质性研究（LBH-Z16152），2016年-2018年，结题；
英国beat365官方网站入口于维汉杰出青年基金：复杂疾病非编码RNA识别和功能分析，2014年-2018年，结题；
英国beat365官方网站入口创新基金项目：基于ncRNA交互网络重构的癌症相关ncRNA优化及调控机制研究（2016JCZX45），2016年-2018年，结题。
主要科研成果及获奖情况
黑龙江省高校科学技术奖：基于生物数据融合的恶性肿瘤中miRNA-ceRNA复合协同调控模式的研究，一等奖（2019年），排名第一；
哈尔滨市自然科学技术学术成果奖：基于miRNA-miRNA功能协同调控网络剖析疾病miRNA的拓扑特性，一等奖（2012年），排名第一；
黑龙江省政府科学技术奖（自然类）：癌风险miRNA及协同调控风险通路(pathway)识别方法研究，二等奖（2015年），排名第三；
黑龙江省高校科学技术奖：癌风险miRNA及协同调控风险通路(pathway)识别方法研究，二等奖（2015年），排名第三；
哈尔滨市自然科学技术学术成果奖：恶性胶质瘤进展相关的miRNA识别以及功能分析，二等奖（2014年），排名第二；
中华医学科技奖：癌风险miRNA及协同调控风险通路(pathway)识别方法研究，三等奖（2016年），排名第三；
哈尔滨市自然科学技术学术成果奖：优化疾病风险miRNA基于其在miRNA-靶基因失调网络中的拓扑特征，优秀奖，（2012年），排名第一；
黑龙江省教育厅：高通量表观遗传修饰数据的整合分析技术平台，（2013年），排名第一；
黑龙江省科技厅：高通量表观遗传修饰数据的整合分析技术平台，（2013年），排名第一；
黑龙江省科技厅：癌症中异常DNA甲基化标记提取技术，（2017年），排名第一。
